尊谥，皇祖神宗显皇帝，诏曰：朕惟帝王御世躬明德而致盛治者，其子孙臣庶必立庙以宗之称天，以谥之用是表因心之达孝，亦将示万世以至公也。洪惟我皇祖考大行皇，帝秉乾纲之上德，抚豫大之昌期，以纯孝奉慈闱，以至仁调庶品，振纲肃纪。每在笃恭不显之中，过化存神聿成端，拱无为之治，威既著于除残禁暴，惠尤深于兴灭存亡。溯四十八载之浃髓沦肌，若南北东西之怀柔震垒，可谓考三皇五帝而不谬对二祖八宗，为有光者矣。兹者率土鞠凶，普天丧考，朕衔哀茹痛，勉嗣洪图，深维继述之初，无若显扬之大。特敕谕文武群臣，稽古论文，传参舆论，形容盛德，恭荐崇称。乃于九月初十日祗告天地宗庙社稷，奉册宝上皇祖考大行皇帝尊谥曰：范天合道哲肃敦简光文章武安仁止孝显皇帝，庙号：神宗。于戏耿光大烈揄扬莫罄夫鸿庥缵绪绍基启佑长思于骏惠，布告遐迩，咸使闻知。

——《明熹宗实录》诏万历皇帝封谥上庙

整个九月，皇城内外都沉浸在一种紧张的氛围之中，一则新皇登基，手段如何尚未可知，二则党争旧事再起，朝中各路人马都在抓紧最后的宁静时间，寻找各自的政治盟友。

转头来到十月初一，福建道御史倪应眷终于打响了朝争的第一枪。东林党人倪应眷上书陈治安六事：“……曰保身，曰定治，曰讲学，曰勤政，曰纳谏，曰谨微。而归重于阁臣之主持，谓权臣不可有，重臣不可无，非权而何以重？……愿上假之以权，丝纶无从中降，阁臣善用其权，意念绝无旁落……”此疏影射内阁，特别是首辅，窃夺国器，有专威擅权的嫌疑。

如果这封奏折是直接递到天启的手中，那大概免不了火筐的命运，但是倪应眷早已知晓皇帝有意袒护方从哲，所有弹劾他的奏章都如泥牛入海一般，杳无音信。于是倪应眷堂而皇之的将这封奏折递给了内阁，并在篇末直言：请阁臣与万岁共勉。

一石激起千层浪，方从哲自己是浙党党魁，他的学生太常寺少卿亓诗教则是齐党党魁，同时方从哲又与黄彦士等楚党众人交好，三党同盟多年，如今三党共主被东林党人如此羞辱，自然是不肯善罢甘休。

随即，三党同盟开始一场蓄谋已久的反击，十月三日，都察院十名御史同时发起对福建布政使（布政使，即承宣布政使，从二品，明代一省的最高行政长官）魏时应的弹劾，说他：在任两年，撅民生息，倭乱横行，非时而授役，忘君而资敌。天启一看这阵势，只得长叹一声：是福不是祸，是祸躲不过。随即下诏，命福建布政使魏时应上自辩疏。

十月十日，福建布政使魏时应的自辩疏抵京，其中一条一条地批驳了御史的弹劾，天启本以为这就该消停了，谁知道这才到开胃菜，真正的“硬菜”在后头呢。

当日朝会上，东林党借口三党同盟无中生有、捏造事实，指名道姓地说首辅方从哲才是背后的主谋，是他在指使御史弹劾魏时应，监察御史张修德直言：“首辅方从哲居心叵测，指使朋党肆意攻讦，拟染指福建军政，甚为可虑！”更有御史吴应奇言：“从哲居内阁而驭疆臣，万岁心可安否？”

天启闻言，脸色为之一变，心中突然拿不定主意了，方从哲到底怎么回事，他是不是真的有异心？

正在天启犹豫之间，方从哲却主动站了出来，“万岁，臣自知老衰昏弱，且朝中谤臣者众，或一死可报君恩，而今再无可能主令枢机，但请告老还乡，做一田翁罢。”说完，方从哲缓缓跪了下来，重重磕了一个头。天启看着他这垂垂老矣的身子，又不忍心真的罢了他的官，只好敷衍到：“方阁老莫要意气用事，但且上自辩疏，朕自有分辨。”

第二天，方从哲的自辩疏就递到了乾清宫，内中只有两行字：百般皆由臣起，臣留，则满朝腾沸，臣去，则万事宁平。是留是去，但请万岁定夺。

天启一看这个，心说：老大人呐老大人，你倒是给朕一点儿提示啊，什么提示都不给，就让做个选择题，那朕怎么知道a正确还是b正确呢？

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